Unite de Recherche 178
Conditions et Territoires d'Emergence des Maladies

Maladies Virales Emergentes et systèmes d'Information - UR 034

-2005/2008 : Doctorant du Muséum National d'Histoire Naturelle (UR: Origine, Structure et Evolution de la Biodiversité), activité de recherche au laboratoire IRD U178 / CVVD , Faculté de Science de l’Université de Mahidol à Salaya (Center for Vector and Vector-Borne diseases), et à la CIBU (Cellule d’Intervention Biologique d’Urgence) de l’Institut Pasteur de Paris. Recherches sur l'implication des mammifères domestiques et sauvages de Thailande (plus particulièrement Chiroptères et Carnivores) dans l'émergence et l'évolution de virus. Plus particulièrement, étude des Coronavirus de Carnivores et Chiroptères de Thaïlande (SRAS) et des virus transportés par les Chiroptères en Thaïlande (Flavivirus, Arenavirus,Hantavirus, Lyssavirus and Hendra/Nipahvirus).

Ces travaux sur les Chiroptères m'ont amené a l'étude plus approfondie de cet ordre mammalien. Les problématiques de complexes d'espèces, de structuration des populations et de leur mobilité, de relation de ces populations avec des agents pathogènes, ont constitué des axes détude majeurs dans le travail effectué en Asie du Sud-Est. La taxonomie et la phylogénie de ce groupe restent encore à compléter et la diversité rencontrée en Asie du Sud-Est offre de nombreuses problématiques de recherche. Le développement de lignée cellulaires a été entrepris dans le cadre d'une étude prospective sur les relations cellulaires et physiologiques des chiroptères avec les virus. Ces lignées sont en cours de développement et certaines ont déjà été utilisée dans l'isolement et la caractérisation d'agents biologiques de chiroptères.

-2004 : Recherche dans le cadre du DEA (Systématique animale et végétale, MNHN) au laboratoire « mammifères et oiseaux », département Origine Structure et Evolution de la Biodiversité (OSEB) du Muséum National d’Histoire Naturellede Paris et dans l’UMR BIPAR (Biologie et Immunologie Parasitaire) de l’Ecole Nationale Vétérinaire d’Alfort, sur le sujet: « Phylogénie moléculaire et hypothèse de coévolution des Pneumocystis spp. Parasites pulmonaires opportunistes de mammifères ; chez les carnivores ». Encadrants : J. Guillot, ENVA, UMR BIPAR

-Juin à août 2003 : Etude des peuplements d’Orchestiaspp. (Crustacé : Amphipode) en baie du Mont St Michel. « Dynamique des populations, contribution à la dégradation de la matière organique des peuplements d’Orchestiaspp. en baie du Mont Saint-Michel»  sous la direction du professeur Alain CANARD dans l’équipe « muséologie et biodiversité » de Rennes1.

-Mai 2003 : Etude des processus physiologiques à l’origine de l’adaptation du chiendentElytrigia eatherica, aux conditions de salinité du moyen schorre. (UMR 6553 ECOBIO sous la direction de Mr L. Leport)

-Février à mai 2003 : Etude du peuplement piscicole d’un polder reconnecté à la mer à l’UMR 6553 ECOBIO "Fonctionnement des Ecosystèmes et Biologie de la Conservation" à Rennes1.

-Mars 2003 : Etude de l’adaptation du coléoptère Alphytobius diaperinus, aux basses températures (UMR 6553 ECOBIO Rennes 1) sous la direction de Mr D. Renault. 

-Août 2002: Membre d'une équipe chargée de l'étude de fréquentation touristique sur Port-cros  et Porquerolles, à l'intention du parc national de Port-cros, sous la direction de Mr Louis Brigand, professeur de géographie à l'UBO de Brest, I.U.E.M,  en vue de légiférer la circulation dans le parc.

-Février à avril 2002: Etude du régime alimentaire des cormorans et de l'impact des oiseaux  piscivores sur les populations de poissons d'eau douce, au moyen de l'examen de pelotes de rejection et de l'étude d'otolithes  à l’UMR 6553 ECOBIO "Fonctionnement des Ecosystèmes et Biologie de la Conservation" à Rennes 1.

 

Formation :

-depuis 2005: Doctorat de biologie à l'école doctorale « Diversité du Vivant » du Muséum National d’Histoire Naturelle de Paris et dans l'unité « Origine Structure et Evolution de la Biodiversité »

-2004: D.E.A de systématique animale et végétale au Muséum National d’Histoire Naturelle de Paris. Dpt OSEB (Origine Structure et Evolution de la Biodiversité).

-2003: Maîtrise de biologie des populations et des écosystèmes à RENNES 1 (entre autre: méthodes d'études statistiques en biologie/ fonctionnement des écosystèmes et interaction des communautés - modélisation / adaptations écophysiologiques aux conditions environnementales/ adaptations écoéthologiques aux conditions d'élevage/ éthologie)

-2002: Licence de biologie des organismes et des populations à l'université de RENNES 1. ( Biochimie, structure et fonction des molécules biologiques/ Génétique/ biologie cellulaire/ Options: organisation et phylogénie des animaux/ Grandes fonctions animales/ Evolution et adaptation/ Bases biologiques de la régulation des comportements et relations entre organismes.)

-Avril 2002: Stage de biologie marine au CEMPAMA de Beg-Meïl; étude de la faune des milieux rocheux et vaso-sableux, dans la zone de balancement des marées. (zoologie, systématique, spatialisation, peuplements.)

-2001: Deug sciences de la vie à l'Université de Bretagne Sud de Lorient.

-Avril 2001: Stage à la station de biologie marine de Baïlleron dans le golfe du Morbihan. (collecte et étude de la faune benthique et pélagique/ étude du plancton/ étude des facteurs abiotiques dans le golfe.)

Autres Renseignements :

-Langues étrangères: anglais, espagnol, rudiments de thailandais (apprentissage de l'écrit et de l'oral en cours).

-Connaissances en informatique:

OS: mac, freeBSD, linux, windows.

Logiciels usuels de traitement de texte et tableur + SGBD, PHP, SQL, HTML;

Statistiques : minitab, bioinfo;

SIG, modélisation;

Inférence phylogénétique outils en biologie: PAUP, Treeview, TCoffe, Poy, SeAl, Clustal, Treemap, MacClade TreeEdit, Amplifix, FinchTV, Mr Bayes, Modeltest …

-Titulaire du Permis B.

-Titulaire l'attestation de formation aux premiers secours.